El Viceministerio de Ciencia y Tecnología es miembro desde 2013.
El Viceministerio de Ciencia y Tecnología de El Salvador fue creado en junio de 2009 mediante Decreto Ejecutivo (N° 12, Artículo 1) como parte del Ministerio de Educación. Fue creado para introducir la tecnología educativa en las escuelas del país y vincular lo tecnológico, científico, educativo y productivo del país.
Su misión es introducir la actividad para la ciencia, la tecnología y la innovación en el país, contribuyendo con otras instancias del Ministerio de Educación, a brindar capacidad profesional para la creación y uso del conocimiento; seguir definiendo y elaborando la Política Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico. Esto se apoya en consultas y pronósticos tecnológicos en conjunto con otros Ministerios, agencias y plataformas institucionales nacionales; Permitir y facilitar el desarrollo de investigaciones científicas, tecnológicas y de innovación que impacten positiva y significativamente en la calidad de vida de la población salvadoreña.
En este sentido, se están desarrollando acciones encaminadas a la introducción de las Tecnologías de la Información y la Comunicación (TIC) como herramienta en el proceso docente - aprendizaje, introducción del enfoque de Ciencia, Tecnología e Innovación (CTI) en la educación, atención al alumnado con desempeño sobresaliente y educación técnica y tecnológica superior
En el área de investigación, en 2010 se crearon dos centros de investigación: el Centro de Investigaciones Científicas de El Salvador (CICES) y el Centro Nacional de Ciencias Sociales y Humanidades (CENISCH) y se crearon el Parque Tecnológico en agroindustria (PTA, 2013) y está prevista la creación de un Parque Tecnológico en Ciencias Exactas e Ingeniería. También se ha conformado el Sistema Nacional de Innovación, así como los instrumentos legales para el desarrollo de la ciencia, la tecnología y la innovación: Ley de Desarrollo Científico y Tecnológico, Política Nacional de Innovación, Ciencia y Tecnología y Plan Nacional de Agenda Científica y Tecnológica. Se han creado instrumentos para la gobernanza de la CTI, como el Comité Interministerial de Ciencia, Tecnología e Innovación, y el Consejo Asesor del Comité Interministerial y Comité de Coordinación de la CTI.