La Academia Palestina de Ciencia y Tecnología fue fundada en 1994 por la Organización para la Liberación de Palestina a petición de la UNESCO. Se estableció oficialmente mediante el Decreto Presidencial n.º 114 en 1997, que reconoció su condición de organización autónoma, no gubernamental y sin ánimo de lucro. Este decreto facultó a la Academia para actuar como el principal organismo de ciencia y tecnología del país, con la misión de asesorar en la formulación de políticas, programas y proyectos para apoyar el desarrollo nacional, y de coordinar las actividades científicas y tecnológicas pertinentes. En consecuencia, la Academia se ha convertido en el centro neurálgico y la organización coordinadora de la ciencia y la tecnología en Palestina.
El Dr. Fathi Arafat fue designado como su primer presidente, con Su Excelencia Yasser Arafat, Presidente de la Autoridad Nacional Palestina, actuando como Presidente Honorario.
En 1998, el Dr. Rafiq Al-Husseini fue nombrado primer Secretario General de la Academia. El Dr. Mohamed Ziara le sucedió como Secretario General Interino en 2000, seguido por el Dr. Imad Al-Khatib a principios de 2001, quien inicialmente ocupó el cargo de Secretario General Interino antes de ser nombrado Secretario General ese mismo año. El Dr. Hikmat Ajjuri fue nombrado Vicepresidente de la Academia.
El estatus de la Academia fue reafirmado por Decreto Presidencial N° 13 de 2004 (en Inglés), consolidándose aún más como una institución nacional, independiente y autónoma. La Academia Palestina de Ciencia y Tecnología desempeña un papel fundamental en el avance de la ciencia, la tecnología y la innovación en Palestina, impulsándolas como motores del desarrollo económico, social y humano. Para lograrlo, la Academia colabora estrechamente con socios del ámbito académico, gubernamental e industrial, tanto a nivel local como internacional. La coordinación y optimización de los esfuerzos nacionales resulta especialmente vital dada la escasez de recursos y los importantes desafíos que se presentan. La Academia tiene su sede en Jerusalén y oficinas adicionales en Ramala y Gaza.